大肠杆菌表达系统
诱导原理:Lac 阻遏物是一种具有 4 个相同亚基的四级结构蛋白,都有一个与诱导剂结合的位点。在没有乳糖存在时,lac 操纵子(元)处于阻遏状态,Lac 阻遏物能与操纵基因 O 结合,阻碍 RNA 聚合酶与 P 序列结合,抑制转录起动。而当有诱导剂与阻遏蛋白结合后,其蛋白构象就发生变化,导致阻遏物从操纵基因 O 上解离下来,RNA 聚合酶不再受阻碍,发生转录。
不包括基因构建等上游操作和蛋白纯化部分。基因构建参考密码子优化,蛋白纯化参考蛋白纯化专题。以下内容主 要包括蛋白表达鉴定:
1.表达鉴定第一天的任务,常用抗性选择根据感受态细胞选择
拿到质粒,离心(3000r/min;2min)
在质粒中加入 TE(使质粒最终加入到 110μL 感受态细胞中的量为 80-100ng,据此确定加入 TE 的量
一般为(1μg 质粒加 20μLTE;2μg 质粒加 50μLTE;5μg 质粒加 100μL TE)
将质粒与 TE 混匀,加入 2μL 混液于感受态细胞中
将感受态细胞放入冰箱(4℃)中,30min
取出后立即放入水浴锅中(42℃),热激 90s,
再次放入冰箱(4℃)中,3min
拿出后取 200μL 的 LB 液体培养基加入到已转入质粒的感受态细胞中
放入摇床(37℃; 195r) 中, 30nim 至 60min; (最佳 45min)
取出离心(3000r/min;2min)
去掉 200μL 的上清,留 100μL 左右上清悬浮沉淀,吸取 50μL 悬液涂平板,(先将对应抗性的平板放入培养箱(37℃)中预热 20min)
把平板放入培养箱(37℃),过夜(12h 至 16h)
2.表达鉴定第二天的任务,注意 Pcold 的表达温度
每个平板挑取单菌落至 4 支对应抗性的 LB(4ml)试管中,编号为“0”“1”“2”“3”
将试管放入摇床(37℃;195r) 中,(单抗 3h 左右;双抗 4 左右;刚开始用可见分光光度计测 OD 值; 熟练后可目测(背光下,以试管中的枪头为例,刚刚看不见枪头即可)),测 OD 值(0.6 至 0.8)
从“0”号管中取 700μL 悬液加入到 100μL(C=80%)的保种甘油中,震匀,放入冰箱(-20℃)冻存
在每组菌的“1”“2”“3”号试管中分别加入 2μL 的 IPTG(终浓度 0.5mM 最适)
视不同的载体选择适合的表达环境(PET/PGEX:15℃表达过夜;25℃表达 6h;37℃表达 3h 至 4h(4 支试管,“0”“1”号试管 15℃表达过夜;“2”“3”试管 37℃表达 3h 至 4h)。Pcold:全部 15℃表达过夜)
3.表达鉴定第三天,全菌的表达鉴定分析,注意控制溶质的量及溶液黏度
从每组 4 支的试管中均取 500μL 菌液加入到 1.5ml 离心管中,(若 OD 值不一样,值小的可多取)离心
(6000r/min),5min, 去上清,留沉淀(沉淀少的,可再取菌液离心,尽量使沉淀量接近)
在每个离心管中加入 500μL 的 DDH2O,悬浮沉淀,离心(6000r/min),5min, 去上清,留沉淀
在每支离心管中加入 45μL 的 1×PBS 和 45μL 的 2×Loading Buffer 悬浮沉淀(当溶质适量且均一的情况下,加入量不变;当溶质多且粘稠时,应使加入量增大,为降低粘度也可减少上液量)
放入煮样器(100℃) 25min
取出后离心(6000r/min) 3min, 电泳检测。
质粒载体:小型环状 DNA,能自我复制。一个完整的质粒载体必须要有复制起点、启动子、插入的目的基因、筛选标记以及终止子;此外对大肠杆菌表达载体的要求是:①操纵子以及相应的的调控序列,外源基因产物可能会对大肠杆菌有毒害作用;②SD 序列,即核糖体识别序列,一般 SD 序列与起始密码子之间间隔 7-13bp 翻译效率最高;③多克隆位点以便目的基因插入到适合位置。
目的基因:在大肠杆菌表达体系中要表达的基因即外源基因,包括原核基因和真核基因;原核基因可以在大肠杆菌中直接表达出来,但是真核基因韩有内含子不能,大肠杆菌不能对 mRNA 进行剪切,从而形成成熟的 mRNA,所以真核基因一般以 cDNA 的形式在大肠杆菌表达系统中表达。此外还需提供大肠杆菌能识别的且能转录翻译真核基因的元件。
表达宿主菌:表达蛋白的生物体即大肠杆菌。表达宿主菌的选择在大肠杆菌蛋白表达过程中是很重要的因素——多数人会直接选择实验室曾经用过的宿主菌,而不去追究原因。对于宿主菌的选择主要根据宿主菌各自的特征及目的蛋白的特性,例如目的蛋白需要形成二硫键,可以选择 Origami 2 系列,Origami 能显著提高细胞质中二硫键形成几率,促进蛋白可溶性及活性表达;目的蛋白含有较多稀有密码子可用Rosetta 2 系列,补充大肠杆菌缺乏的七种(AUA,AGG,AGA,CUA,CCC,GGA 及 CGG)稀有密码子对应的 tRNA,提高外源基因的表达水平。
大肠杆菌表达现象 | 可能原因 | 建议宿主菌 |
无蛋白表达或出现截短蛋白 | 密码子偏移性 | Rosetta 2 Rosetta gami 2 Rosetta gami B rigami 2 Rosetta gami 2Rosetta gami B |
细胞死亡,生长极困难 | 基因产物为毒性蛋白 | |
蛋白无活性 | 蛋白错误折叠 | |
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大肠杆菌表达系统种类
T7 大肠杆菌表达系统
以 T7 启动子、T7RNA 聚合酶等 T7 噬箘体转录体系的元件为核心构建的表达系统。T7 RNA 聚合酶一种高活性的RNA 聚合酶,mRNA 的合成速度比大肠杆菌内的 RNA 聚合酶快 5 倍,并某些不能被大肠杆菌 RNA 聚合酶转录的序列也可以转录,所以 T7 RNA 聚合酶和 T7 噬箘体启动子的存在的情况下,大肠杆菌本身的转录竞争不过 T7 噬箘体转录体系,最终受 T7 噬箘体启动子控制基因的转录。
Lac 和 Tac 大肠杆菌表达系统
它是以大肠杆菌 lac 操纵子调控机理为基础设计、构建的大肠杆菌表达系统,具有多顺反子结构,结构排列为:
启动子(lacP)- 操纵基因(lacO) - 结构基因(lacZ-lacY-lacA)
原理:在无诱导物的情况下,负调节因子 lacI 基因产物形成四聚体阻遏蛋白与启动子下游的操纵基因紧密结合,阻止转录的起始。加入诱导剂后,IPTG 与 lacI 基因产物结合,使操纵基因解离出来,lac 操纵子的转录因此被激活。用 tac 启动子构建的表达系统称为 Tac 表达系统。
PL 和 PR 大肠杆菌表达系统
以启动子 PL、PR 为核心构建的表达系统。PL 和 PR 表达系统具有很强的启动转录能力,诱导时不需要加入化学诱导剂,成本低廉,但在热刺激过程中,大肠杆菌中的一些蛋白水解酶会被激活,降解所表达的外源蛋白;其次是在 大规模发酵培养菌体时,通过热平衡交换方式提高温度,需要较长的时间,这会降低诱导效果,从而对重组蛋白的表达量有影响。
此外还有其他表达系统,如 pH 调控型、营养调控型、糖原调控型等。
大肠杆菌表达系统比较
种类 | 优点 | 缺点 |
T7 大肠杆菌表达系统 | 目的基因的表达水平高 | 较高的本底表达 对表达和制备用于医疗的重组蛋白不适合 |
Lac 表达系统 | 易于调控和操作 | |
Tac 表达系统 | 易于调控,转录水平高于 lac | |
PL 和 PR 表达系统 | 不需要加入化学诱导剂,成本又低廉,转录能力强 |
大肠杆菌与其他表达系统比较
种类 | 优点 | 缺点 |
大肠杆菌表达系统 | 大肠杆菌表达系统具有表达背景清楚,表达水平高, 操作简单,培养周期短,抗污染能力强 | 表达真核基因只能用其 cDNA,不能进行翻译后的修饰加工,含有大量内毒素 |
哺乳动物表达系统
| 可以使蛋白正确折叠,提供复杂的 N 型糖基化和准确的 O 型糖基化等加工修饰,更接近于天然蛋白 | 产率低,某些糖基化产物不稳定、不易纯化,费用昂贵
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酵母表达系统 | 使用简单,表达量高,可大规模生产,与原核相比 可对异源蛋白修饰 | 酵母表达蛋白有时会出现蛋白切割问题。
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昆虫表达系统 | 使用简单,表达量高,可大规模生产,与原核相比 可对异源蛋白修饰 | 外源蛋白表达处于极晚期病毒启动子的 调控之下,由于病毒感染,细胞开始死亡, 无法进行连续性表达 |